IX–X вв. – время появления на европейской арене венгров. Сквозные трепанации были достаточно популярны среди завоевателей и проходили, как правило, успешно. Свыше 5 % известных науке мадьярских черепов того времени несут следы краниотомий. Обычно трепанировали мужчин, в три раза реже – женщин.

Первый случай средневековой трепанации в Венгрии был обнаружен в 1853 г. в погребении X в. близ Вереба и опубликован археологом Яношем Эрди в 1858 г., на несколько лет раньше знаменитого перуанского черепа, привлекшего внимание Брока.

Здесь, вместе со своим конем, был похоронен молодой мужчина знатного происхождения. В его могиле были найдены стремена, остатки богато украшенной конской упряжи, серебряные перстень, браслет, монеты, нашитые на одежду покойного, поясные украшения из бронзы и позолоченного серебра, колчан и стрелы с железными наконечниками. Правая сторона черепа была прикрыта серебряным листом, под которым и обнаружилась трепанация. Этот кусок металла, по всей видимости, был элементом головного убора, защищавшим место, где была проведена операция при жизни молодого воина.

Вообще стоит заметить, что среди 134 трепанаций, обнаруженных впоследствии исследователями Карпатского бассейна, 73 были сделаны именно в X в. Впрочем, трепанации практиковали и предшествующие жители этой территории – авары в VI–IX вв.

Арабы сохранили и приумножили опыт античной хирургии для европейцев. В XI веке Авиценна рекомендует трепанацию для лечения меланхолии, «если ничто другое не помогает». Еще раньше подробнейшие медицинские рекомендации составляет живущий в Кордове Абулкасис.

В 1060 г. Константин Африканский перевел арабские медицинские тексты для школы в Салерно. В XI–XIII вв. центр краниотомий существует в Парме. В XIII в. Роландо ди Парма пишет «Хирургию».

Роджериус Фругарди (примерно 1170–1200-е гг.), иначе известный как Роджер Салернский, составляет описание ранений головы и перечисляет показания к трепанированию. Его метод сходен с рекомендациями Цельса. Он переводит на французский язык «Хирургию» Роландо Пармского. Ги де Шольяк (1320–1386 гг.), лечивший Авиньонских пап Клемента VI, Иннокентия VI и Урбана V, запрещает оперировать при полной луне, потому что «мозг содержит душу». Суеверия, связанные с полнолунием, нашли отражение и в знаменитом «Молоте ведьм», который помогает понять опасения средневековых лекарей. «…Демоны беспокоят людей при росте луны… Так как мозг, согласно учению Аристотеля, является наиболее важной частью тела, то он больше всего подчинен влиянию луны, обладающей способностью производить движение жидкости. В мозгу же совершенствуются силы души. Вот почему при увеличении луны демоны волнуют воображение человека. Ведь они видят, что его мозг хорошо предрасположен к этому».

Археологи находят останки трепанированных людей при раскопках средневековых кладбищ Италии, Греции, Сербии, Чехии, Германии, Дании.

По сообщению китайского источника («Новая история династии Тань») в 1061 г., среди людей Та-Чин (Сирия) были опытные знахари, которые лечили слепоту, вскрывая мозг и извлекая оттуда червей.

В 1040 г. в Китае опубликовано жизнеописание «знаменитых целителей всех эпох», написанное Чоу-Шоу-Чангом. Он позаимствовал описания двух способов трепанирования из более раннего трактата, появившегося между 960 и 1040 гг. В 1136 г. Ван Ен Ю издал новую книгу, в которой описывалась необычная операция. Один человек был приговорен к казни за поджог, но перед смертью захотел продемонстрировать свой талант хирурга. К нему был приведен прокаженный, которому преступник сделал операцию и «извлек у него из головы червя».

Кем же были те избранные, которым делали сложные хирургические операции на черепе? Как мы уже успели убедиться, в ранние эпохи, по данным антропологии, чаще всего трепанировали мужчин. Иногда сопутствующий останкам погребальный инвентарь позволяет говорить о том, что это были воины или люди, имевшие высокий социальный статус.

Начиная со Средневековья, мы имеем возможность опираться не только на антропологию и археологию, но и на письменные свидетельства тогдашних летописцев. Кроме того, до нас дошли многочисленные произведения изобразительного искусства и даже имена некоторых особенно знаменитых хирургов.

Мыслители Высокого Возрождения и идущие им вослед хирурги Нового времени проявляют большой интерес к нейрохирургическим операциям. Известно, что около 1500 г. итальянец Джиованни Виго оперировал пациентов с высоким внутричерепным давлением. Теофраст Бомбаст фон Хоэнхайм (Парацельс) вскрывал черепа больным эпилепсией. Во Франции прославился медик последних королей династии Валуа Амбруаз Паре (1510–1590 гг.). В 1519 г. житель Нюрнберга Й. фон Меекре’н опубликовал медицинский трактат с описанием краниотомии. В том же году голландец Маас исследовал повреждения разных отделов головного мозга и наступавший в результате паралич. Марк Аврелий Северин пробовал лечить хирургическим путем меланхолию и эпилепсию. В 1575 г. Алькасар из Саламанки трепанировал пациента с внутричерепным кровоизлиянием. Возросший интерес к анатомии человека выражался в многочисленных вскрытиях тел людей, погибших во время чумы или от несчастных случаев. Во второй половине XVI и в начале XVII в. этот интерес приобрел массовый характер. Часто вскрытию подвергали тела известных и могущественных исторических деятелей – например, основателя ордена иезуитов Игнатия Лойолы, Марчелло Мальпиги, герцога Альбрехта V Баварского. Современные антропологи находят свидетельства активности патологоанатомов того времени. Так, в одной из церквей Гессена в 1600 г. были захоронены останки мужчины, верхняя часть черепа которого была удалена с целью изучения строения головного мозга.