10 ноября — в Москве учреждается общероссийское политическое общественное движение «Рефах».
17 ноября — председатель ДУМ «Ассоциация мечетей» муфтий Махмуд Велитов заявляет о сложении своих полномочий и присоединении к ЦДУМ.
24-25 ноября — в Москве проходит расширенное совместное заседание Совета муфтиев России и ВКЦДУМР, итогом которого становится их объединение. ВКЦДУМР фактически прекращает свое существование.
23 декабря — на встрече глав и представителей Русской Православной Церкви, ЦДУМ, Совета муфтиев России, Конгресса еврейских религиозных организаций и объединений и Буддийской традиционной сангхи России принимается решение об образовании Межрелигиозного совета России.
1999
18 января — ДУМ Центрально-Европейского региона России (ДУМЦЕР) проходит перерегистрацию и меняет название на ДУМ Европейской части России (ДУМЕР).
12 февраля — в Омске открывается Съезд мусульман Сибири, в котором принимает участие председатель ЦДУМ верховный муфтий Талгат Таджуддин. Съезд осуждает «раскольнические действия ДУМАЧР».
13- 14 февраля — в Тюмени проходит II Форум ДУМАЧР. Происходит окончательное формирование административно- территориальной структуры этого муфтията.
Начало апреля — сторонники ДУМЕР устанавливают контроль над Исторической мечетью в Москве.
9 апреля — главный цензор ДУМ РТ Фарид Салман Хайдаров заявляет о выходе из этой структуры. Вскоре он создает собственный муфтият — Региональное ДУМ Татарстана в составе
ЦДУМ и становится его муфтием. Начинается борьба между ДУМ РТ и ЦДУМ.
8 июня — в г. Булгар (Республика Татарстан) проходит VIII Внеочередной съезд ЦДУМ, приуроченный к 1110-й годовщине со дня принятия ислама Волжской Булгарией. На Съезде утверждаются типовые уставы ЦДУМ, региональных ДУМов и махаллей (приходов).
6 августа — начинается вторжение чеченских группировок в Дагестан. Ваххабиты Кадарского анклава вступают в боевые действия на стороне боевиков.
Август — движение «Рефах» входит в состав политического блока «Единство» и становится его «блокобразующей партией».
27 августа — в Москве проходит Учредительный съезд Общероссийского Союза общественных объединений «Меджлис». Новое движение призывает все мусульманские партии России объединиться под его эгидой для участия в парламентских выборах.
9 и 13 сентября — террористы взрывают дома на улице Гурьянова и на Каширском шоссе в Москве. Одним из главных подозреваемых в организации террористических актов становится уроженец Узбекистана Денис Сайтаков, шакирд (студент) набережночелнинского медресе «Иолдыз».
1 б сентября — на сессии дагестанского парламента объявляется о запрещении ваххабизма на территории Республики Дагестан.
2 октября — сотрудниками правоохранительных органов г. Набережные Челны задерживается имам-хатыб центральной мечети «Таубе», выпускник медресе «Иолдыз» Айрат Вахитов. Ему предъявляется обвинение по статье 208, часть вторая Уголовного кодекса России — участие в вооруженных формированиях, не предусмотренных федеральным законом. Вскоре еще 10 бывших студентов «Иолдыза» объявляются в розыск в связи с их участием в чеченских бандформированиях.
2 октября — в Уфе проходит Совет муфтиев ЦДУМ, приуроченный к торжествам по случаю 10-летия Исламского института им. Ризаетдина бин Фахретдина. По итогам Совета принимается обращение, акцентирующее внимание на прогрессирующем распространении ваххабизма в Российской Федерации.
б октября — сотрудники ФСБ задерживают находящегося в федеральном розыске председателя Союза мусульман России Надиршаха Хачилаева.